Defecten in de eerste coronavirus diagnostische kits in de VS

Door een fout in de reagentia is het onmogelijk om het werkelijke testresultaat te kennen van de eerste 1.235 geteste patiënten in het land. En bureaucratie, die tot nu toe andere laboratoria belette hun eigen diagnostische systemen te creëren, heeft de situatie alleen maar verergerd

Weinig gezondheidsinstellingen over de hele wereld zijn zo erkend als de Amerikaanse Centers for Disease Control and Prevention (CDC). Dat is de reden waarom zijn onhandige actie in verband met de uitvoering van coronavirus diagnostische tests (COVID-19) in het hele land is zo verontrustend. Terwijl andere landen in staat zijn geweest om miljoenen tests uit te voeren, op het moment van schrijven, heeft de CDC onderzocht slechts 1.235 patiënten. Om te gaan met een tijdige epidemie, snelheid wordt essentieel, en CDC fouten zijn al van invloed op uitbraak monitoring in de VS.

Op 5 februari, CDC begon het verzenden van de kits met de coronavirus test, maar het werd al snel ontdekt dat velen van hen had gebreken in negatieve controles (die verschijnt wanneer er geen coronavirus), veroorzaakt door besmette reagentia. Dit is waarschijnlijk een bijwerking van het werken in een haast om de kits te maken. Labs met de verkeerde negatieve controles moesten hun monsters rechtstreeks naar de CDC sturen voor analyse.

CDC kits zijn gebaseerd op polymerase kettingreactie (PCR) tests, die miljoenen of miljarden kopieën van een DNA-monster produceren, zodat artsen gemakkelijk kunnen identificeren en analyseren. PCR is een bekende technologie die al 35 jaar bestaat. In deze tijd is het proces verbeterd met bijvoorbeeld enzymen en reagentia van hogere kwaliteit, waardoor de nauwkeurigheid van de precieze stoffen kan worden verhoogd en doelen in realtime kunnen worden gedetecteerd, zelfs terwijl de test nog aan de gang is.

Dus hoe is het mogelijk dat de CDC verkeerd is geweest over iets zo bewezen en trouw?

Het eerste ding om te weten is dat de PCR-test is zeer gevoelig. De reagentia moeten zeer schoon zijn, en de geringste verontreinigingen kunnen het volledig bederven (zoals in dit geval gebeurde). Een negatieve controle die het verkeerde virale genoom detecteert en een vals-positief genereert, is praktisch het ergste geval, omdat het alle andere testresultaten in twijfel trekt: het is niet bekend of de monsters daadwerkelijk positief zijn of dat ze er alleen maar op lijken door besmetting. “In principe is het niet mogelijk om te weten of de resultaten juist zijn,” legt Griffith University directeur infectieziekten en immunologie, Nigel McMillan.

DNA-versterking in de PCR-test moet beginnen met het gebruik van korte strengen complementair aan het doel-DNA, die kappers worden genoemd. Het hoofd van de virologie aan de Universiteit van Washington, USA, Keith Jerome, merkt op dat “het ontwerp van de feeders blijft een soort kunst, en niet volledig voorspelbaar.” Zelfs wanneer er een goede database van virale sequenties, niet alle sets gerst die geschikt lijken op een computer zal goed werken in de werkelijkheid.

Dit zijn veelvoorkomende problemen die niet alleen de PCR-test kunnen beïnvloeden, maar ook de detectie van nieuwe virussen of infectieziekten. McMillan zegt: “Echter, in het geval van de CDC, ik weet zeker dat het ongehoord. Ze zijn meestal heel voorzichtig met deze dingen.”

Maar, je hoeft niet de schuld van de PCR-test voor het gebrek aan betrouwbaar bewijs. Volgens de directeur klinische microbiologie aan de Universiteit van Michigan (VS), Duane Newton, de grootste beperking in de diagnose is niet de technologie, maar de regelgevende goedkeuringsproces voor nieuwe tests en platforms. Hoewel dit proces van cruciaal belang is voor het waarborgen van veiligheid en efficiëntie, blokkeren onvermijdelijke vertragingen vaak “de bereidheid en het vermogen van fabrikanten en laboratoria om middelen te investeren in de ontwikkeling en implementatie van nieuwe tests”, legt hij uit.

In dit specifieke geval, de Amerikaanse Food and Drug Administration (FDA) regels in eerste instantie verhinderd staat en commerciële laboratoria van de ontwikkeling van hun eigen coronavirus diagnostische tests, zelfs als ze konden ontwikkelen coronavirus PCR feeders zelf. Dus, toen de enige test beschikbaar plotseling bleek te zijn gebrekkig, niemand wist welke sets van feeders werkten.